農田水利會設立後，遇有自然環境變遷或水資源規劃變更時，主管機關得依職權或經農田水利會之申請，對各該農田水利會及其事業區域為合併、分立、變更或廢止之決定。
農田水利會為前項之申請時，須經會務委員會之決議及會員過半數之同意簽署行之。