納稅義務人每年結算申報所得額經核定後，稽徵機關應就納稅義務人全年應納稅額，減除暫繳稅額，未抵繳之扣繳稅額，及申報自行繳納稅額後之餘額，填發繳款書，通知納稅義務人繳納。
納稅義務人結算申報，經核定全年應納稅額，小於暫繳稅款及尚未抵繳之扣繳稅款者，稽徵機關應即填發收入退還書或國庫支票，退還溢繳稅款，並依當地銀錢業通行之存款利率，按日加計利息一併退還。
其後經復查，或訴願，或行政訴訟決定應退稅或補稅者，稽徵機關應填發繳款書，或收入退還書或國庫支票，送達納稅義務人，分別退補。應補稅之納稅義務人，應於繳款書送達後十日內繳納之。
前二、三兩項應退還之稅款，稽徵機關於核定後，應儘速填發收入退還書或國庫支票送達納稅義務人，至遲不得超過十五日，退稅期間以收入退還書或國庫支票送達之日起一個月內為有效期間，逾期不退。