農田水利會會長因故出缺時，主管機關為直轄市主管機關者，由直轄市主管機關派員代理其職務；其他各農田水利會，由中央主管機關派員代理其職務，並應於代理之日起六十日內重新遴派；其任期以補足原任會長未滿之任期為止，並以一任計算。但原任會長未滿之任期不及一年者，得不遴派。