稽徵機關進行調查，如認為納稅義務人有故意以詐欺或其他不正當方法逃稅嫌疑時，得敘明事由，申請當地司法機關簽發搜索票後，會同當地警察或自治人員，進入藏置帳簿文件或證物之處所，實施搜查，搜查時非上述機關人員不得參與，經搜查獲得有關帳簿文件或證物，統由參加搜查人員，會同攜回該管稽徵機關，依法處理。
司法機關接到稽徵機關前項申請時，如認有理由，應儘速簽發搜索票，稽徵機關應於搜索票簽發後十日內執行完畢，並將搜索票繳回司法機關。
其他有關搜索及扣押事項，準用刑事訴訟法之規定。