行政院置秘書長一人，特任；副秘書長一人，簡任，秘書長承院長之命，處理本院事務，並指揮監督所屬職員，副秘書長承院長之命，襄助秘書長處理本院事務。
秘書長及副秘書長應列席行政院會議。