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第三十五條
原條文
98/11/06 修正版本
中小企業為改進生產技術、發展新產品而支付之研究發展、實驗費用，准在當年度課稅所得內減除。供研究發展、實驗或品質檢驗用之儀器設備，其耐用年數在二年以上者，准按所得稅法固定資產耐用年數表所載年數，縮短二分之一計算折舊；縮短後餘數不滿一年者，不予計算。
103/05/20 修正版本
說明
一、現行研發費用本就係以費用列支而於課稅所得內減除，故原條文前段雖名為獎勵研發之租稅優惠，實際上並無任何實惠。
二、產業創新條例第十條雖亦訂有研發租稅獎勵，惟受限於相關子法之「高度創新」門檻，致使中小企業難以享受政府所賦予之研發租稅獎勵，對中小企業有所不公。
三、為實質鼓勵中小企業研發創新，其研發費用之一定比率可抵減應納之營利事業所得稅。
四、原條文第一項後段之規定，挪增為第二項。
五、有關本條租稅抵減之相關事項，明定由行政院定之。
二、產業創新條例第十條雖亦訂有研發租稅獎勵，惟受限於相關子法之「高度創新」門檻，致使中小企業難以享受政府所賦予之研發租稅獎勵，對中小企業有所不公。
三、為實質鼓勵中小企業研發創新，其研發費用之一定比率可抵減應納之營利事業所得稅。
四、原條文第一項後段之規定，挪增為第二項。
五、有關本條租稅抵減之相關事項，明定由行政院定之。
第三十五條之一
此條文為新增條文，無原條文可比對。
103/05/20 修正版本
為促進創新研發成果之流通及應用，中小企業以其享有所有權之智慧財產權，讓與非屬上市、上櫃或興櫃公司，所取得之新發行股票，免予計入該企業當年度營利事業所得額課稅。
個人以其享有所有權之智慧財產權，讓與非屬上市、上櫃或興櫃之公司時，該個人所得之新發行股票，免予計入其當年度綜合所得額課稅。
前二項股票於實際轉讓、贈與或作為遺產分配時，應將全部轉讓價格，或贈與、遺產分配時之時價作為該轉讓、贈與或遺產分配年度之收益，並於扣除取得前開股票之相關而尚未認列之費用或成本後，申報課徵所得稅。
前項股票發行公司於辦理前項規定之股票移轉過戶手續時，應於移轉過戶之次日起三十日內，向所在地稅捐稽徵機關申報。發行公司依前項規定應申報而未依限申報、未據實申報或未依限填發規定格式之憑單者，除依限責令補申報及填發憑單外，並按該股票轉讓金額處百分之二十之罰鍰。
中小企業或個人計算第二項及第三項所得時，如無法提出取得成本之證明時，得以其轉讓價格百分之三十計算該股票之取得成本。
個人以其享有所有權之智慧財產權，讓與非屬上市、上櫃或興櫃之公司時，該個人所得之新發行股票，免予計入其當年度綜合所得額課稅。
前二項股票於實際轉讓、贈與或作為遺產分配時，應將全部轉讓價格，或贈與、遺產分配時之時價作為該轉讓、贈與或遺產分配年度之收益，並於扣除取得前開股票之相關而尚未認列之費用或成本後，申報課徵所得稅。
前項股票發行公司於辦理前項規定之股票移轉過戶手續時，應於移轉過戶之次日起三十日內，向所在地稅捐稽徵機關申報。發行公司依前項規定應申報而未依限申報、未據實申報或未依限填發規定格式之憑單者，除依限責令補申報及填發憑單外，並按該股票轉讓金額處百分之二十之罰鍰。
中小企業或個人計算第二項及第三項所得時，如無法提出取得成本之證明時，得以其轉讓價格百分之三十計算該股票之取得成本。
說明
一、本條新增。
二、如個人或中小企業因智慧財產權所取得之收益為股票時，因僅係取得股權，尚未有實際現金入袋，日後轉讓之收益未必與取得當時相當，如立即課徵所得稅實有未妥，爰明定自其轉讓、贈與或作為遺產分配時，該等技術股始予課徵所得稅。
三、為避免個人或中小企業無法舉證證明其研發成本，比照生技新藥產業發展條例第七條、原促進產業升級條例第十九之二條之規定，推定其研發成本為百分之三十。
二、如個人或中小企業因智慧財產權所取得之收益為股票時，因僅係取得股權，尚未有實際現金入袋，日後轉讓之收益未必與取得當時相當，如立即課徵所得稅實有未妥，爰明定自其轉讓、贈與或作為遺產分配時，該等技術股始予課徵所得稅。
三、為避免個人或中小企業無法舉證證明其研發成本，比照生技新藥產業發展條例第七條、原促進產業升級條例第十九之二條之規定，推定其研發成本為百分之三十。
第三十六條之二
此條文為新增條文，無原條文可比對。
103/05/20 修正版本
為因應國際經濟情勢變化，促進國內中小企業投資意願及提升國內就業率，經濟景氣指數達一定情形下，新投資創立或增資擴展之中小企業達一定投資額，增僱一定人數之員工且提高該企業整體薪資給付總額時，得就其每年增僱本國籍員工所支付薪資金額之百分之一百三十限度內，自其增僱當年度營利事業所得額中減除。
中小企業於本條適用期間，不符合前項要件，自不符合要件之年度起，依所得稅法規定計算其營利事業所得額及應納稅額。
第一項經濟景氣指數達一定情形、適用期間、投資額、增僱員工之對象及人數、企業整體薪資給付總額、核定機關、申請期限、申請程序及其他相關事項，由行政院定之。
中小企業於本條適用期間，不符合前項要件，自不符合要件之年度起，依所得稅法規定計算其營利事業所得額及應納稅額。
第一項經濟景氣指數達一定情形、適用期間、投資額、增僱員工之對象及人數、企業整體薪資給付總額、核定機關、申請期限、申請程序及其他相關事項，由行政院定之。
說明
一、本條新增。
二、為因應嚴峻之國際經濟情勢，增加投資、創造就業，立即加強經濟成長之動力並吸引外資來台，爰訂定本條文。如新投資創立或增資擴展中小企業達一定金額且增僱一定人數之本國籍之員工得享有租稅抵減優惠。
三、有關啟動本租稅優惠條文之經濟景氣指數、適用之產業別、投資額、僱用員工對象及人數、核定機關、申請期限、申請程序及其他相關事項，由行政院定之。
二、為因應嚴峻之國際經濟情勢，增加投資、創造就業，立即加強經濟成長之動力並吸引外資來台，爰訂定本條文。如新投資創立或增資擴展中小企業達一定金額且增僱一定人數之本國籍之員工得享有租稅抵減優惠。
三、有關啟動本租稅優惠條文之經濟景氣指數、適用之產業別、投資額、僱用員工對象及人數、核定機關、申請期限、申請程序及其他相關事項，由行政院定之。
第三十六條之三
此條文為新增條文，無原條文可比對。
103/05/20 修正版本
產業創新條例中如有與本條例相同性質之租稅優惠，中小企業僅得擇一適用。
說明
為避免中小企業有重複獎勵之情事，如產創條例中有相同性質之租稅優惠，中小企業僅得擇一適用。
第四十條
原條文
98/11/06 修正版本
本條例自公布日施行。
103/05/20 修正版本
說明
為兼顧經濟發展及財政公平，配合稅捐稽徵法第十一條之四規定，稅法或其他法律為特定政策所規定之租稅優惠，應明定實施年限。爰參照產業創新條例第七十二條租稅優惠相關條文適用期間為十年，明定本條例第三十五條、第三十五條之一及第三十六條之二施行期間自中華民國○年○月○日起十年。
