按前三條規定計得之個人綜合所得總額，減除左列免稅額、寬減額及扣除額後之餘額，為個人之綜合所得淨額：
一、個人免稅額：納稅義務人按規定減除個人免稅額；其有配偶者，加倍減除之。
二、扶養親屬寬減額：納稅義務人所扶養之親屬中，合於左列規定者，每年每人得減除其扶養親屬寬減額：
（一）納稅義務人及其配偶之直系尊親屬，年滿六十歲，或無謀生能力，受納稅義務人扶養者。
（二）納稅義務人之子女未滿二十歲，或滿二十歲以上而因在校就學、身心殘廢或因無謀生能力受納稅義務人扶養，未超過兩人者，但於中華民國七十二年十二月三十一日以前出生者，不在此限。
（三）納稅義務人之同胞兄弟、姊妹未滿二十歲者，或滿二十歲以上，而因在校就學、或因身心殘廢，或因無謀生能力，受納稅義務人扶養者。
（四）納稅義務人之其他親屬或家屬，合於民法第一千一百十四條第四款及第一千一百二十三條第三項之規定，未滿二十歲或滿六十歲以上無謀生能力，確係受納稅義務人扶養者。但受扶養者之父或母如屬第四條第一款及第二款之免稅所得者，不得列報減除。
三、扣除額：
（一）稅捐：依法完納之田賦、地價稅、房屋稅及其附加捐。
（二）捐贈：對於教育、文化、公益慈善機構或團體之捐贈，以捐贈總額最高不超過綜合所得總額百分之二十為限。但有關國防、勞軍之捐贈及對政府之捐獻，不受金額之限制。
（三）保險費：納稅義務人本人、配偶及直系親屬之人身保險、勞工保險及軍、公、教保險之保險費。但每人每年扣除數額以不超過四千元為限。
（四）醫藥及生育費：納稅義務人及其配偶或其同居受扶養親屬之醫藥費及生育費，以付與公立醫院、公務人員保險特約醫院、勞工保險特約醫療院、所，或經財政部認定其會計紀錄完備正確之醫院者為限。
（五）災害損失：納稅義務人遭受不可抗力之災害損失。但受有保險賠償或救濟金部分，不得扣除。
（六）財產交易損失：納稅義務人財產交易之損失，其每年度扣除額，以不超過當年度申報之財產交易之所得為限；當年度無財產交易所得可資扣除，或扣除不足者，得以以後三年度之財產交易所得扣除之。財產交易損失之計算，準用第十四條第一項第七類關於計算財產交易增益之規定。
（七）薪資所得特別扣除：納稅義務人及與納稅義務人合併申報之個人有薪資所得者，每人每年得就其申報之薪資所得扣除百分之二十。其每人每年扣除金額，以不超過九千元為限。但夫妻均有薪資所得，且夫非屬第四條第一款及第二款之免稅所得者，妻一方申報之薪資所得得扣除百分之三十。其每年扣除金額以不超過一萬一千元為限。
（八）儲蓄投資特別扣除：納稅義務人及與其合併申報之配偶暨受其扶養親屬之各種利息、屬於儲蓄性質信託資金之收益及公司公開發行並上市之記名股票之股利，合計全年不超過十二萬元者，得全數扣除，超過十二萬元者，以扣除十二萬元為限。但依郵政法規定免稅之存簿儲金利息及本法規定分離課稅之短期票券利息不包括在內。
納稅義務人對於前項第三款第一目至第五目規定之各項扣除額，不逐項列舉及舉證者，得申報按標準扣除額扣除之；其數額以納稅義務人綜合所得總額百分之十為限，最多不得超過九千元。但綜合所得總額之百分之十不足七千元者，得扣至七千元。
依第七十一條第二項規定免辦結算申報者，及應辦理結算申報而未辦理，經稽徵機關核定應納稅額者，均不適用第一項第三款第一目至第五目所列舉之扣除規定。

國際金融業務分行對中華民國境內個人、法人、政府機關或金融機構放款之利息，除依法免稅者外，應由該分行於第七十一條規定期限內，就其利息收入總額按規定之扣繳率申報納稅。

第八十八條各類所得稅款之扣繳義務人，應於每月十日前將上一月內所扣稅款向國庫繳清，並於每年一月底前將上一年內扣繳各納稅義務人之稅款數額，開具扣繳憑單，彙報該管稽徵機關查核。但營利事業有解散、廢止、合併或轉讓，或機關、團體裁撤、變更，薪資所得納稅義務人中途離職，利息所得納稅義務人提清存款，或承租人中途退租時，扣繳義務人應隨時就已扣繳稅款數額，填發扣繳憑單，並於十日內向該管稽徵機關辦理申請。
非中華民國境內居住之個人，或在中華民國境內無固定營業場所之營利事業，有第八十八條規定之各類所得時，扣繳義務人應於代扣稅款之日起十日內，將所扣稅款向國庫繳清，並開具扣繳憑單，向該管稽徵機關申報核驗。

會計師或其他合法代理人，為納稅義務人代辦有關應行估計、報告、申請、申請復查、訴願、行政訴訟，證明帳目內容及其他有關稅務事項，違反本法規定時，得由該管稽徵機關層報財政部依法懲處，其為會計師者核轉經濟部依法懲戒之。