原住民族綜合發展基金目前主要任務係提供原住民從事發展經濟事業、建購及修繕住宅貸款信用保證之融資，以協助改善原住民族生活。惟近年來，經濟環境變遷甚大，除現行經濟事業需繼續輔導之外，尚有推動政府興辦或獎勵民間興辦原住民族住宅，以協助其居住之需要，為協助籌措其所需財源，爰增列住宅之興辦、出租、出售、建購及修繕業務為基金辦理業務；並明定興辦住宅之出租、出售所得收益款為基金收入來源。

一、原住民基本法第十九條制定之初，因未考量到以海洋文化為主的阿美族與達悟族，保障範圍僅限於原住民鄉政之行政轄區範圍而未含括部落傳統生活海域，致使以海為生的阿美族人及達悟族人在進行傳統海祭時屢遭海巡署驅離或者取締，迫使延續千百年的漁獵文化面臨滅絕危機。
二、為保障原住民族傳統海洋漁撈文化，增修原住民得在經中央原住民主管機關公告之海域從事非營利行為，其相關辦法由中央原住民族主管機關會商中央目的事業主管機關定之。