一、修正第一項。原住民族或部落所在之土地不以公有為限，亦有產權屬私有者，而不論於公、私有土地從事土地開發、資源利用、生態保育、學術研究等行為，皆會影響當地原住民族或部落，故刪除限於公有土地之規定。

二、原住民族土地係指原住民傳統領域土地及既有原住民保留地（同法第二條第五款參照）。過往由於傳統領域尚未劃定，行政機關僅會對考量原住民保留地之影響，但事實上原住民保留地外圍大多為其傳統領域，於其中從事土地開發等行為亦會對當地原住民族或部落產生影響，遂有規範之必要。惟傳統領域之範圍擴及部落以外之地方，其概念已涵蓋現行條文所謂周邊一定範圍，爰予以修正。

三、修正第二項。參酌原條文第三項。

四、修正第三項。過往行政機關作成涉及土地利用等權利之決定前，未有通知或詢問部落之強制程序。部落缺乏合適地知悉、參與管道，往往只能承受限制之結果，嚴重影響其生活與生產之使用。因此，為落實部落參與相關行政程序的機制，爰規定相關行政行為應通知部落並取得其同意，且非經同意者該行政行為不生效力。

五、修正第四項。強化部落參與相關行政程序之權利。

六、增訂第六項。行政機關依法限制人民財產權而造成人民損失者，應給予補償。因此，行政行為造成原住民族或部落之財產損失，應由作成行政行為之機關寬列預算予以補償。關於補償之技術性、細節性事項，另授權中央主管機關訂定之。